%0 Journal Article 
%A Benítez Mateo, Álvaro
%T Análisis de secuencias repetidas de ADN en el lenguado Solea senegalensis mediante tratamiento de datos procedentes de NGS (Next Generation Sequencing)
%D 2018
%U http://hdl.handle.net/10498/20695
%X Los elementos repetitivos conforman un gran porcentaje del genoma de los seres vivos.
Además, suponen un enorme impacto en la regulación génica, la inactivación y eliminación de
genes, en la estructura cromosómica y en la evolución de los genomas. Por otra parte, el rápido
desarrollo de las tecnologías de secuenciación masiva de genomas permite obtener una gran
cantidad de información que ha de ser tratada con herramientas bioinformáticas para poder ser
anotada y organizada. Por todo ello, se han analizado cuatro paquetes de datos procedentes de la
secuenciación del transcriptoma de Solea senegalensis mediante la plataforma Galaxy-
RepeatExplorer, siendo esta una especie de pez de gran importancia económica y que está
siendo estudiada a fin de solucionar los problemas que rodean su cría en cautividad.
Los análisis de los datos han permitido obtener más de 2.500 clusters indicativos de
posibles elementos repetitivos, de los cuales se han analizado los 32 más significativos. Así, se
han encontrado varios elementos que pueden constituir satélites y retrotransposones que no se
hallaban en las bases de datos consultadas, mostrándose este como un sistema muy eficiente de
identificación y caracterización de posibles elementos repetitivos de novo en especies no
modelo. Además, una vez establecido el proceso, se ha generado un diagrama de trabajo o
workflow que recoge los diferentes pasos llevados a cabo con las herramientas disponibles en la
plataforma Galaxy-RepeatExplorer para llegar a obtener los resultados mostrados.

%K NGS
%K Solea senegalensis
%K RepeatExplorer
%K Elementos repetitivos
%K Genómica
%K Transcriptómica
%K Bioinformática
%~ Universidad de Cádiz