Localización de miRNAs en el genoma del lenguado senegalés (Solea senegalensis, Kaup 1858)

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Localización de miRNAs en el genoma del lenguado senegalés (Solea senegalensis, Kaup 1858)

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Title: Localización de miRNAs en el genoma del lenguado senegalés (Solea senegalensis, Kaup 1858)
Author: Ramírez Torres, Daniel
Director/Advisor: Arias Pérez, Alberto; Rebordinos Gonzalez, Laureana
Departments: Biología
Abstract: Actualmente existe un creciente interés en diversificar el cultivo de peces y su comercialización. Es por esto que en la región sur atlántica españolagran parte de los esfuerzos y proyectos realizados se enfocan en nuevas especies de peces comerciales, entre las que se incluye el lenguado senegalés. Hoy en día se desarrollan numerosos proyectos de investigación con el objetivo de conseguir llevar a cabo la producción de Solea senelgalensis, la cual está limitada dada la dificultad para conseguir la reproducción de esta especie en cautividad. Las especies como el lenguado senegalés junto al lenguado común, el rodaballo o el fletan muestran un gran interés en acuicultura debido a sus características; presentando un alto precio en mercado y acrecentando el interés en su cultivo. En la actualidad, teniendo en cuenta que el cultivo del lenguado senegalés no se ha conseguido de forma integral y dado que el control de su reproducción no es tan conocido como el de otras especies cultivadas es de interés la realización de un estudio que permita ampliar los conocimientos sobre la naturaleza de esta especie con el fin de aportar información que pueda contribuir al desarrollo de la reproducción y producción de esta especie. El presente proyecto bioinformático pretende un estudio de Solea senegalensis desde un punto de vista genético con el objetivo principal profundizar en la caracterización del genoma del lenguado senegalés a través del estudio de datos obtenidos de genotecas BAC y de microRNAs, los cuales toman parte en la regulación de la expresión génica y cuyo estudio ayudaría a conocer mejor los mecanismos que regulan determinados aspectos de interés como son el crecimiento o la reproducción, procesos fundamentales en acuicultura. Tras la creación de una base de datos para S. senegalensis y la realización de comparaciones entre grupos de secuencias con herramientas Blast®, recurriendo a información sobre secuencias miRNA maduras ya descritas, se obtuvo como resultado un total de 260 secuencias con similitud a miRNAs identificados previamente en otras especies, llevando a cabo un estudio de la relación de estas secuencias con los miRNAs con los que presentaron homología, describiendo las posibles funciones de los mismos.Currently there is a growing interest in diversifyingfish aquaculture and its commercialization. As far as the Spanish Atlantic region is concerned, much of the effort and projects are devoted to new species of commercial fishes, including Solea senegalensis. Nowadays, research projects are being carried out with the aim of achieve the production of senegalese sole, which is limited due to the difficulty of reproduction in captivity. Species such as senegalese sole along with common sole, turbot or halibut show great interest in aquaculture due to its characteristics, presenting a high price in the market and increasing the interest in its cultivation. Nowadays, considering that the senegalese sole has not been fully cultivated since the control of its reproduction is not as well known as that of other cultivated species, it is of interest to carry out a study in order to increase the knowledge about the nature of this species that can contribute to the development of its reproduction and production. The present bioinformatic project aims to a study of Solea senegalensis from a genetic point of view with the main objective to deepen the characterization of the senegalese sole genome through the study of BAC and microRNAs libraries data, which take part in the gene expression regulation and its study to better understand the mechanisms that regulate the parameters of interest such as growth or reproduction, fundamental processes in aquaculture. Following the creation of a S. Senegalensisdatabase and comparisons between groups of sequences using Blast® tools, using information on mature miRNA sequences already described, a total of 260 sequences with similarity to identified miRNAs previously in other species were obtained, carrying out a study of the relation of these sequences with miRNAs which homology was presented, describing their possible functions.
Subject: Solea senegalensis ; genética ; bioinformática ; microRNA ; genoma ; acuicultura.
Handle: http://hdl.handle.net/10498/19868
Date: 2017-09-19

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