Análisis Comparativo de Intrones en Especies de Peces Planos (Pleuronectiformes)

Abstract

Los intrones suponen una proporción significativa del genoma, la cual influye en procesos vitales como la regulación de la expresión génica, la evolución molecular y la plasticidad adaptativa. Sin embargo, tanto su organización como variabilidad entre las especies de peces planos aún no se encuentra caracterizada por completo.

El principal objetivo de este trabajo fue analizar la distribución de la longitud intrónica, así como el contenido en GC y la relación entre GC3 con los intrones en cinco especies de peces planos: Cynoglossus semilaevis, Solea senegalensis, Scophthalmus maximus, Paralichthys olivaceus e Hippoglossus hippoglossus.

Para ello se emplearon genomas completos obtenidos de bases de datos públicas (NCBI) así como archivos de anotación GTF. Estos datos se procesaron y analizaron mediante scripts en R, donde se generaron resúmenes estadísticos, histogramas de distribución, análisis comparativos por cromosoma y modelos de regresión para intentar explicar la relación entre GC3 y la longitud de los intrones.

El tamaño del genoma demostró la presencia de variabilidad entre especies, aunque la distribución de los intrones dentro de cada cromosoma resultó relativamente homogénea, con predominio de intrones cortos. El contenido de GC fue de valores intermedios (38%-41%), lo cual sugiere un papel de relevancia en la estabilidad estructural así como la eficiencia del splicing. La regresión entre GC3 y la longitud intrónica reveló la presencia de correlaciones muy débiles, indicando que el contenido GC no es el único factor influyente en la organización intrónica, ya que existen otros factores evolutivos.

El estudio sirve como confirmación de la importancia de los intrones en la configuración del genoma de peces planos, destacando principalmente su papel en la regulación génica y en la evolución genómica. Además, los resultados aportan información de interés para futuros estudios comparativos y sus aplicaciones en acuicultura y biología evolutiva.